长湖申线是长江三角洲地区的骨干航道，西起长兴县小浦镇，经湖州入江苏省，至上海市接黄浦江到苏州河口，全长225.4千米。其中湖州境内段78.4千米，是湖州连接上海、融入长三角的水上大动脉，是市域内一条真正的“黄金水道”。

　　湖州经济的发展，历来与长湖申线休戚相关。新中国成立后的30多年间，各级党委、政府多次拓浚改造航道，但因“上面给多少钱、下面办多少事”的计划模式，长湖申线的通航能力越来越不适应经济发展的需要，一些航段淤塞严重，许多堤岸塌损陷落，经常堵航的“瓶颈”越来越多。20世纪80年代，随着经济快速发展，这条繁忙的水上运输线更加不堪重负，湖州市河及三济桥等处每年阻塞船队近千个。当时有位航道专家曾在南浔建设桥上画了6个小时的“正”字，计算后发现平均每分钟通过船只竟多达3.8艘。“无船无瘪、无桥无疤”，湖州人以此来形容长湖申航道的窘况。

　　长湖申航道淤塞严重，堵航事故不断，引起了省、市乃至中央领导的关注。尤其是时任中共中央总书记胡耀邦，对长湖申线航道改善工程作了重要批示。于是，在1984年，国家有关部委经过前期调研，出台了关于京杭运河南段和长湖申线整治设想。次年7月，交通部会同长江航务管理局和上海、江苏、浙江等省市有关专家69人，对长湖申线航道进行了为期11天的考察，在综合各方观点的基础上，提出了“航运与水资源综合利用”“近期实施与远期规划”“国家投资与地方集资”三个相结合为指导思想的实施方案。根据方案要求，1985年11月，湖州市政府成立了长湖申线改建领导小组，市政府主要领导担任组长，并在市航管处设立了专门的改建办公室。至此，湖州长湖申航道按照国家计划委员会和交通部的批复，即“湖州以上近期六级、远期五级标准，湖州以下近期五级、远期四级，跨航建筑物按远期标准建设”的要求，开始了由部分航段到全线改造的大规模建设。

　　在1986年至1990年的“七五”计划期间，长湖申航道的改造重点围绕“卡脖子”航段进行。其中南浔市河改善工程于1986年4月开工建设，1988年10月完工，按五级标准改善航道2.34千米，总投资654万元。湖州市河改线工程于1987年8月开工，1990年10月完工，新开2.4公里航道，新建300吨船闸、防洪闸和城东大桥等多项工程，总投资2436万元。进入20世纪90年代后，市委、市政府又先后对长兴吕山至湖州城西霅水桥段、市区3个市河瓶颈航段、长兴杨湾至吕山段进行了改造，使长湖申线近期改造建设目标全部完成。

　　在重点航段改造工程基本完成之后，1995年12月，长湖申线湖州段航道获准实施全线改造。其中，长兴小浦至霅水桥30.56千米按五级航道标准改造，霅水桥至南浔段44.68千米按四级航道标准改造。在全线开工建设后，各施工段从1998年起陆续完工，并在2000年至2002年间分段通过了验收。最终于2002年10月、2003年12月分别通过了湖州市区段和长兴段的竣工验收，实际改造航道76.56千米，开挖土方463.2万立方米，新建护岸39.14千米，新建改建跨航桥梁15座，征用土地1086亩，拆迁房屋7.34万平方米，工程总投资2.16亿元。

　　这次全线改造工程实施后，湖州境内的长湖申线航运条件得到较大改善，其中，小浦镇湾桥至霅水桥31.84千米，航道尺度基本达到五级航道标准；霅水桥至南浔44.72千米，基本达到四级航道标准。随之，长湖申线湖州段航道的货物流量也大大增加，2001年通过量4002万吨，2004年增至6795万吨，2005年达到7437万吨，主要为煤炭、水泥、木材、非金属矿石、矿建材料和成品油等，成为一条名副其实的“黄金水道”，为湖州经济发展作出了重要贡献。

　　然而，长湖申线航道大规模全线改造提升，仍滞后于经济社会发展的步伐。2000年以后，随着货物流量的迅猛增长，堵航事故依然频发。其中湖州段2003年出现堵航事故31次，累计堵航时间长达2232小时。为此，在2004年9月，交通部出台了《长江三角洲地区高等级航道网规划》（简称《规划》），明确长湖申线为长三角地区“两纵六横”高等级航道网中23条骨干航道之一，规划为三级航道。根据交通部的《规划》要求，长湖申线湖州段高等级航道工程于2008年7月正式开工建设，计划改造扩建航道77.7千米。至2013年，历经5年时间，总投资18.59亿元的改扩建工程基本完成。改造后，小浦合溪至帅家村15.1千米达到四级航道标准，帅家村至南浔航段60千米和帅家村至长兴铁水中转港支线2.6千米达到三级航道标准。另外，还新建护岸124.3千米、修复护岸14.8千米，开挖土方880万立方米，新建改建跨航桥梁24座、水闸2座，新建服务区3处、锚泊处3处，同时配套建设航道标志、绿化等，共征地3639亩，拆迁房屋16万平方米。经过此次全线改造，长湖申线湖州段基本达到高等级航道的标准，通航船舶500至1000吨，大大提升了航运能力。

　　2017年后，长湖申线航道西延工程又动工建设。该工程起于安吉县递铺街道阳光坝，终至湖州船闸，航道全长66.34千米，其中安吉阳光坝至长兴港口水文站段按天然四级航道标准建设，长兴港口水文站至湖州船闸按限制性三级航道标准建设，总投资21亿多元。长湖申线西延工程的建设，进一步改善了湖州西部地区的通航条件，改变了安吉县无高等级航道的状况，成为全市发展“海河联运”，促进临港经济发展，实现内河水运转型升级的重要支撑。

　　与此同时，湖州市还大力推进“水运生态”建设，争创“绿色航道”示范，将“绿水青山就是金山银山”理念融入航道建设、养护、管理的各个环节，使长湖申线成为湖州境内的一条“美丽航道”，成为名副其实的“中国小莱茵河”。